بسبب الأمراض المختلفة التي تصيب أعضاء الجهاز الهضمي قد يستوجب إزالة العضو ذات الصلة بأكمله أو إزالة قسم منه. في مرض قرحة المعدة مثلا إزالة جزء من الأمعاء الغليظة بسبب الانسدادات في الأمعاء الغليظة من المعدة. إزالة العضو كاملا أو جزء منه يكون كافيا في هذه الأمراض ذات الصلة. لكن الأستئصال الجراحي فقط لنفس العضو المصاب بالسرطان لا يكون كافي. بالإضافة الى ذلك يجب إزالة جميع العقد الليمفاوية التي قد تسبب في انتشار السرطان. لهذا، في الحالات السرطانية للجزء الأخير من الأمعاء الغليظة يجب ان تتم عملية تنظيف الغدد الليمفاوية التي تسمى باستئصال كامل الأنسجة وفي حالات سرطان المعدة يجب إزالة DII الليمفاوية. عندما يتم مراعاة هذه المبادئ غالبا ما تكون النتائج أفضل. عند معالجة السرطان جراحيا يتم ايضا أعتماد نهج التخصصات المتعددة. في هذا الصدد، يمكن تحديد الخطة العلاجية الخاصة بالمريض من خلال المناقشات التي تجري في مجالس العلاج الجراحي لمرضى السرطان التي تتضمن تخصصات متعددة في مجال الأورام ويتم من خلال هذه المجالس اختيار طريقة العلاج المفتوحة – المغلقة (بالمنظار) والروبوتات.